Für die Bayerische Mannschaftsmeisterschaft der Jugend U16 ist aus jedem Bezirksverband ein Verein spielberechtigt. Jede Mannschaft besteht aus 4 Jugendlichen U16.
Die Bayerische Mannschaftsmeisterschaft der Jugend U16 wird in einer Vorrunde und einer Endrunde ausgetragen. Die Vorrunde wird im KO-System ausgetragen. Hierzu werden die Mannschaften der Nord- (Mfr, Ofr, Opf, Ufr) und Südgruppe (Mch, Ndb, Obb, Swb) nach dem DWZ-Schnitt der besten vier sortiert (Stichtag 1.4.), wobei nur Spieler berücksichtigt werden, die im zurückliegenden Kalenderjahr mindestens 5 gewertete Spiele absolviert haben. Anschließend werden jeweils die zwei besten Teams gegen die beiden anderen gepaart, wobei ggf. regionale Gesichtspunkte zu berücksichtigen sind. Die vier siegreichen Mannschaften ermitteln in einer zentralen Endrunde den Meister.
Die Bedenkzeit beträgt 2 Stunden für die ersten 40 Züge, anschließend 30 Minuten je Spieler für den Rest der Partie.
Die Endrunde ist zeitlich so auszutragen, daß der Sieger noch an den Aufstiegsspielen zu den Jugend-Landesligen teilnehmen kann.